Quest'area è dedicata alle iniziative intraprese dalla Regione Molise in merito alle problematiche dell'ambiente fisico, della difesa del suolo, dell'assetto e della pianificazione territoriale, dell'uso compatibile del suolo, della protezione civile per le emergenze da dissesto idrogeologico. Le principali attività condotte dall'ente si concretizzano in indagini sul territorio per il censimento, la conoscenza ed il monitoraggio delle aree instabili; nella prevenzione dal rischio sismico ed idrogelologico, soprattutto delle aree urbane e delle opere pubbliche di interesse regionale; nella gestione dei vincoli a carattere geo-morfologico dei centri abitati classificati come instabili; nella realizzazione delle carte geologiche e geo-tematiche regionali; nella microzonazione sismica dei centri abitati; nei rapporti con le Autorità di Bacino a valenza regionale.